Vẫn diễn ra trong ngôi trường Bullworth Academy, Bully: Scholarship Edition theo chân cậu học sinh mới Jimmy Hopkins, một đứa trẻ vị thành niên đầy chiến tích trong các vụ ẩu đả. Giống như những gì bạn có thể mong đợi từ một game của Rockstar, trò chơi vẫn có cốt truyện hấp dẫn, rất nhiều pha hành động, loạn đả và bạo lực, một môi trường mở, đầy minigame và... gây ra nhiều tranh cãi. Cốt truyện chính không khác biệt so với sản phẩm từng xuất hiện trên PS2.

Scholarship Edition vẫn bao gồm những nhiệm vụ chơi đơn giống bản cũ nhưng có thêm 8 nhiệm vụ mới xuyên suốt trò chơi. Chưa có mode online, nhưng khả năng chơi nhiều người offline từ PS2 đã được nâng cấp thêm trong sản phẩm lần này, khi game thủ có tới 4 lớp học mới để thử sức là Toán, Nhạc, Sinh và Địa.

Trong bản demo mới nhất trên Wii, người chơi được lao vào minigame trong giờ Sinh khi Jimmy và cậu bạn Gary cùng chạy đua với nhau để xem ai mổ động vật nhanh hơn. Những con vật bị mổ cũng khá giống với những gì mà học sinh Việt Nam được học ở trường là cá, ếch... và thậm chí là cả chuột hay người ngoài hành tinh.

Điều khiển Wiimote có vẻ rất phù hợp với cách chơi nhiều người của Bully: Scholarship Edition. Để giải phẫu, người chơi chọn kính lúp trong game, sử dụng điều khiển để phóng to vật cần nhìn, sau đó chọn dao mổ để rạch theo những vết đánh dấu sẵn, rồi tìm hiểu về da, cơ quan nội tạng của động vật... Càng thực hiện chính xác, bạn càng được điểm cao. Bản Xbox 360 cũng có những bài tập tương tự nhưng sử dụng sự kết hợp giữa các phím bấm để thực hiện.